日本的哪个政府机构名称取自典籍《尚书》中的词语？

答案解析：厚生劳动省的名称确实源自中国古典文献《尚书》中的词语。”厚生”一词出自《尚书·大禹谟》中的”正德、利用、厚生、惟和”，意指使人民生活富足、健康。选项B是正确答案。文部科学省的名称则是由”文部”和”科学”两个词组合而成，”文部”主要负责教育和文化事务，而”科学”则指科技发展，其名称并没有直接来源于《尚书》。所以，正确答案是B.厚生劳动省。